realist, though, Elliott says
progress in standardization
is slow because even within
a single department, us-
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
The force that could drive
both standardization of
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
better data integration, says
Elliott, “is the move toward
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
To the wish list of infor-
matics improvements, Da-
the adds features that give
data context: when and
where they were collected
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
should be linked to relevant
molecular and clinical infor-
mation and the entire data-
generating process, includ-
ing the type and status of
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Being Open-Minded
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
president of LabKey Software, which develops tools for data
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and multisite collaboration, he says, means project managers
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ally data integration for multisite collaborative projects that
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Science Outreach Director Elizabeth Nelson, “so we believe it’s
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Open source code allows researchers to tailor their systems,
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that directly address Dathe’s call for giving context to data,
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gust 2013, open source and open access came together via
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For a clinical trial of a vasculitis therapy published in the New
England Journal of Medicine, ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
was used to create a web portal with free public access to
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Researchers who are committed to transparency and are
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Boettiger, an ecology and
evolution postdoctoral re-
searcher at the University
of California, Santa Cruz
has traveled the entire DIY
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
tiger started keeping public-
ly accessible lab records in
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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in and edit other peoples’
notes, although that rarely
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to platforms that give him
increasing control over his
research records, starting
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Boettiger now uses the on-
line software development
site GitHub as his notebook and Jekyll website-generating soft-
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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to people at conferences or answering reviewer requests, he
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What’s Next
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toward more open and collaborative, more secure, and more
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pharma development and information technology specialist in
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Barcoding will note reagents, samples, and instruments used,
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tire process will be recorded, showing the provenance of every
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more extensive record that can be transparent or shared if you
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research by capturing experimental details with no manual data
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470
sciencemag.org/products SCIENCE
LIFE SCIENCE TECHNOLOGIES
DIGITAL LAB MANAGEMENT
Produced by the Science;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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Atrium Research & Consulting
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LabArchives
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Labguru
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LabKey Software
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LabLynx
;;;;;;;;;;;;;;;
LIMSwiki
;;;;;;;;;;;;;;;;
LEO Pharma
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Roche
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University of California,
Santa Cruz
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Chris Tachibana is a science writer based in Seattle, USA, and
Copenhagen, Denmark.
Featured Participants
University of Toledo
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Additional Resources
Core Informatics
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Evernote
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GitHub
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IDBS
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Jekyll
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OpenWetWare
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PerkinElmer
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